課程資訊
課程名稱
基因體數量分析方法
Quantitative Medthod Genomic Research 
開課學期
102-2 
授課對象
學程  分子醫學學分學程  
授課教師
程蘊菁 
課號
EPM7174 
課程識別碼
849 M0690 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期一7,8(14:20~16:20) 
上課地點
公衛210 
備註
與賴亮全、蔡孟勳、林靖愉、劉貞佑、施惟量合開
限學士班三年級以上
總人數上限:30人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1022EPM7174_QMGR 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程主旨在於學習如何分析基因體及遺傳相關的資料,目的在於循序漸進以進行基因體及遺傳相關研究。課程內容分為二大部份:基因體及遺傳關聯分析以及其於不同領域之應用。針對每一部分,先介紹實驗設計,接下來運用各種遺傳軟體進行實際分析。修課學生以具備遺傳學、生物統計或生物資訊的背景,或相關研究的經驗為佳。學生將需繳交作業與期中、期末報告。
 

課程目標
訊練學生做基因相關研究的實務分析能力 
課程要求
英文文獻的閱讀及遺傳分析軟體之操作 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
1) Human Genome Epidemiology
Khoury MJ, Little J, Burke W (Eds.) 2004
2) Introduction to Genetic Analysis
Griffiths AJF, Wessler SR, Lewontin RC, Carroll SB (Eds.) 9th ed., 2008
 
參考書目
1) Statistical Methods in Genetic Epidemiology, Duncan C. Thomas Oxford 2004.



 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
課堂參與 
20% 
 
2. 
期中及期末報告 
50% 
期中:25%; 期末:25% 
3. 
作業  
30% 
每份作業10% 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
02/17  前言
Introduction 
第2週
02/24  遺傳關聯性研究設計 (作業1)
Study Design of Genetic Association Study (HW1)
 
第3週
03/03  遺傳標記的選取
Selection of Genetic Markers
 
第4週
03/10  遺傳半型block與連鎖不平衡測定 (作業2)
Haplotype Block and Hardy-Weinberg Equilibrium Test (HW2)
 
第5週
03/17  單一核苷酸多型性分析
SNP Analyses
 
第6週
03/24  遺傳半型分析 (作業3)
Haplotype Analyses (HW3)
 
第7週
03/31  多重測定之校正 (胡賦強老師)
Special talk: Correction for Multiple Tests
 
第8週
04/07  期中討論及報告I
Midterm Discussion and Presentation I
(陳昱安、楊菀婷、謝青宙、王育婷)
 
第9週
04/14  期中討論及報告II
Midterm Discussion and Presentation II
(劉書岑、蘇煖燕、黃宇康)
 
第10週
04/21  全基因關聯研究
Genome-Wide Association Study
 
第11週
04/28  代謝體學圖譜及資料分析 (林靖愉老師)
Spectral and Data analysis in Metabolomics
 
第12週
05/05  表基因體學簡介及觀念 (劉貞佑老師)
Epigenetics: Introduction and general concepts
 
第13週
05/12  探討潛在生物路徑 (蔡孟勳老師)
Explore potential Biological Pathways
 
第14週
05/19  傳染遺傳流行病學 (施惟量老師)
Infectious-Disease Related Genetic Association Research 
第15週
05/26  非轉錄RNA之簡介及觀念 (賴亮全老師)
Introduction and general concepts of Non-Coding RNA
 
第16週
06/02  端午節放假
Dragon Boat Festival
 
第17週
06/09  期末報告 I
Final Presentation I
 
第18週
06/16  期末報告II
Final Presentation II